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摘 要:本发明公开了一种基于滑动窗口的基因序列多聚腺苷酸尾巴提取方法,特点是包括输入基因序列文件查找连续N个A碱基片段和连续N个T碱基片段作为潜在的多聚腺苷酸尾巴的起始位置的步骤;初始化设置滑动窗口参数并移动滑动窗口直到滑动窗口到达序列最右或左端,或者错配惩罚值达到阈值5则停止滑动,获得多聚腺苷酸尾巴序列和尾巴长度值的步骤;若提供该物种的参考基因组序列,将待比对序列通过序列比对工具与参考基因组序列进行比对或者使用过滤条件过滤多聚腺苷酸尾巴,获得精确度更高的多聚腺苷酸尾巴,并根据多聚腺苷酸尾巴数量确定序列类型的步骤;最后确定多聚腺苷酸尾巴为类型的步骤,优点是精度高、运算速度快且用户友好。
著 录 项:
专利/申请号: | CN202210110546.7 | 专利名称: | 一种基于滑动窗口的基因序列多聚腺苷酸尾巴提取方法 |
申请日: | 2022-01-29 | 申请/专利权人 | 苏州大学 |
专利类型: | 发明 | 地址: | 江苏省苏州市相城区济学路8号 |
专利状态: | 已下证 查询审查信息 | 分类号: | G16B20/30搜分类 基因工程搜索 |
公开/公告日: | 2022-06-03 | 转让价格: | 面议 |
公开/公告号: | CN114582419A | 交易状态: | 等待洽谈 搜索相似专利 |
交易方 | 企业 | 个人 |
买家 | 营业执照副本复印件(需盖公章) | 身份证复印件(签字) |
专利转让委托书(需盖公章)一式两份 | 专利转让委托书(需签字)一式两份 | |
专利转让协议(需盖公章)一式两份 | 专利转让协议(需签字)一式两份 | |
卖家 | 营业执照副本复印件(需盖公章) | 身份证复印件(需申请人签字) |
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专利转让协议(需盖公章)一式两份 | 专利转让协议(需签字)一式两份 | |
专利请求书或手续合格通知书、授权通知书复印件 | 专利请求书或手续合格通知书、专利授权通知书复印件 | |
专利证原件(若授权下证) | 专利证原件(若授权下证) |
日期 | 法律信息 | 备注 |
2023/02/10 | 授权 | |
2022/06/21 | 实质审查的生效 | IPC(主分类): G16B 20/30 专利申请号: 202210110546.7 申请日: 2022.01.29 |
2022/06/03 | 公开 |