发明专利已授权

一种基于三段式滑动窗口的DNA绑定残基的预测方法

📄 申请号：CN202210786251.1 📄 发布日：2026/08/04

著录项目信息

申请日

2022-07-04

公开号

CN115019879B

公开日

2025-04-11

申请人

浙江工业大学

法律状态

已下证

专利类型

发明

主分类号

G16B15_30

IPC 分类号

G16B15_30 , G16B50_00 ,

技术画像

所属领域

生物信息学生物信息学人工智能算法序列分析

应用场景

蛋白质功能注释, 药物靶点发现, 基因功能研究, 疾病机理研究, 生物医药

AI 智能推荐 · 同申请人专利 · 搜索相似专利

摘要

一种基于三段式滑动窗口的DNA绑定残基预测方法，首先，根据输入待进行DNA绑定残基预测的蛋白质序列信息P，其残基个数为L，使用PSI‑BLAST程序搜索蛋白质序列数据库UniRef90生成一个大小为L×20位置特异性评分矩阵，使用SANN程序获取一个大小为L×3的溶剂可及性特征矩阵，通过one‑hot编码方式获取一个大小为L×20的特征矩阵；然后，将三种特征矩阵拼接为一个L×43的超级特征矩阵，即蛋白质每个残基对应一个1×43的特征向量，通过余弦相似度得到两两残基间的特征向量的相似度，即残基相似度；其次，采用三段式滑动窗口技术对超级矩阵中的每个残基进行特征视图处理，并将这些特征视图扩展为特征向量；再次，利用已知DNA绑定残基的蛋白质序列生成对应的特征向量与标签输入支持向量机进行训练；最后，将待预测的蛋白质序列生成的特征向量输入到训练好的模型中，预测蛋白质序列中的残基是否为DNA绑定残基。本发明计算代价小、预测精度高。

权利要求书 (12项) 说明书附图

……

图1

图2

图3

法律状态时间线

一种基于数据增强和标签生成的发酵红茶儿茶素定量方法

当前第 / 件

多肽标签、高度可溶性的重组腈水解酶及其在医药化学品合成中的应用

同领域国内专利 · IPC: (G16B15_30)

G16B15_00 G16B15_20 G16B15_30 覆盖3个领域

议价

不含过户费

📋 交易方式： 委托待转让 📌 交易状态：在售 👁️ 浏览次数：17 ❤️ 收藏人数：93 📋 项目申报： 未申报

资金托管权属尽调包过户

🏢 淄博智来知识产权服务有限公司

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