发明专利已授权

一种基于模板的多域蛋白结构组装方法

📄 申请号：CN201710256156.X 📄 发布日：2026/08/04

著录项目信息

申请日

2017-04-19

公开号

CN107180164B

公开日

2020-02-21

申请人

浙江工业大学

法律状态

已下证

专利类型

发明

主分类号

G16B15_20

IPC 分类号

G16B15_20

技术画像

所属领域

蛋白质结构预测蛋白质结构预测结构域组装生物信息学

应用场景

药物研发, 蛋白质功能预测, 结构生物学研究, 生物计算, 靶点发现

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摘要

一种基于模板的多域蛋白结构组装方法，首先，根据各域蛋白的结构，利用蛋白质结构比对工具TM‑align一次对各域蛋白进行比对，从多域蛋白数据库中找出最佳模板；然后，利用Kabsch方法获取旋转平移矩阵，将各域蛋白重叠到模板上，并对各域蛋白进行平移旋转操作，使其之间的距离等于最小允许距离；其次，通过对组装结构进行随机的平移和旋转进行调整，并利用域蛋白之间的冲突因子、相互作用的原子数量，以及组装结构相对模板的移动幅度来衡量组装结构的质量；在组装过程中，依次组装相邻的域蛋白，并将已组装完的结构固定，当所有结构组装完成后，输出最后组装结果。本发明提供一种预测精度较高的基于模板的多域蛋白结构组装方法。

权利要求书 (12项) 说明书附图

……

图1

图2

图3

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