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本发明公开了一种基于单个量子点水平检测DNA糖基化酶活性的方法。检测时，DNA糖基化酶hOGG1会特异性识别并切除损伤鸟嘌呤，留下一个脱碱基位点，脱嘌呤核酸内切酶?1会对脱碱基位点进一步剪切，留下一个核苷酸的缺口，DNA聚合酶β将Cy5?dGTP聚合在该缺口处，生成双标记的双链核苷酸底物，通过生物素与链霉亲合素之间的特异性反应，DNA底物会结合在覆盖有链霉亲合素的量子点的表面，形成QD?DNA?Cy5复合物，空间距离缩小，导致量子点和Cy5之间发生荧光共振能量转移，从而可以在单分子水平观察到Cy5的荧光信号。本发明所述检测方法简单、快速、灵敏，检测下限可达1.8×10?6U/μL。