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本发明公开了基于梯度增强决策树预测环状RNA与疾病相关性的方法，通过将环状RNA‑疾病关系网络转化为无向图、计算环状RNA碱基序列相似性、功能注释语义相似性以及表达相似性，计算疾病功能以及语义相似性，采用多网络融合算法整合多种环状RNA相似性网络以及加权平均整合疾病相似性网络，提取融合后的环状RNA和疾病相似性网络以及环状RNA‑疾病关系网络的统计学特征，将融合后的环状RNA和疾病相似性网络转换成无权图的图相关特征，环状RNA碱基序列特征以及环状RNA‑疾病关系网络隐式向量特征，训练梯度增强决策树学习机，预测潜在环状RNA‑疾病关系。本发明方法能准确地预测出潜在环状RNA‑疾病关系；且提高了环状RNA‑疾病关系的预测准确率。

本发明公开了一种环状RNA原位检测方法，通过滚环扩增实现对信号的放大，其前提是将检测目标核酸分子转化为检测与目标核酸分子特异对应的环状核酸分子。该方法通过一条单链DNA构成锁式探针的两段区域与目标核酸的靶序列特异杂交，当探针两端的碱基与靶序列完全互补时，DNA连接酶将探针两端连接形成一个环状DNA分子，而后通过滚环扩增对环状DNA分子进行扩增，最后再用检测探针检测扩增产物实现对目标RNA的检测。本发明能够高灵敏地检测环状RNA在不同组织或者同一组织不同部位的存在和分布状况。

本发明属于家畜分子生物学技术领域，具体涉及一种与猪有腔卵泡闭锁相关的circRNA、其siRNA抑制剂及其应用；所述circRNA为circSLC41A1，其线性核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示；本发明针对circSLC41A1设计特异性扩增引物，经PCR扩增、RNase R酶消化及荧光原位杂交验证所述的circSLC41A1的真实存在；利用荧光定量PCR检测到circSLC41A1在猪卵巢中健康有腔卵泡组织中表达高于闭锁卵泡，用siRNA干扰技术证实circSLC41A1对颗粒细胞凋亡具有显著抑制作用；同时，本发明设计并提供一种可作为circSLC41A1抑制剂的小RNA；本发明公开的circSLC41A1有望作为母猪繁殖相关的分子标志物，为猪繁殖性状的评价，繁殖力提升，为人类卵泡异常相关疾病的发生和预防提供新的理论基础和潜在的分子标靶。