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本发明提供一种异型曲面的区域划分方法及系统，所述区域划分方法包括：获取三维曲面的点云数据集合；采用k‑means算法对点云数据集合中点云数据进行聚类运算，获得每一类曲面的初始类内数据点和初始边界数据点；利用条件概率算法对每一类曲面的初始边界数据点进行重新分类；根据重新分类前后的每一类的内数据点的数量，计算最大分类误差；根据最大分类误差判断分类稳定性，若不稳定，重新聚类；若稳定，输出分类结果。本发明采用条件概率算法和k‑means算法实现区域划分，解决k‑means算法中存在的边界不清晰的技术缺陷，使曲面划分更加容易达到稳定，提高了异型曲面划分的稳定性，保证划分结果统一，进而实现对异型曲面加工的高效率化、高质量化。