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本发明提供了一种针对乌贼巨型轴突中动作电位的建模方法。首先，采用FitzHugh‑Nagumo模型描述乌贼巨型轴突中动作电位的发起与传递的离子机制。再根据FitzHugh‑Nagumo模型参数的弱先验知识，并结合所建立的FitzHugh‑Nagumo模型生成数据集。建立由卷积层、池化层和全连接层构成的用于FitzHugh‑Nagumo模型参数估计的神经网络。利用模拟退火算法对所建立的神经网络超参数进行整定。将整定好超参数的神经网络用于FitzHugh‑Nagumo模型参数估计。对乌贼巨型轴突中动作电位进行建模。本发明避免了神经网络超参数的选择问题，从而节省了繁琐的人工试凑过程，大大减少了训练集的大小，分析了噪声在训练和/或测试数据中的影响，还考虑并分析了训练集的大小对参数估计结果的影响，且得到的参数估计结果较好。