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本发明涉及试验优化技术领域，具体为基于图形模型的生物医药试验优化系统，基于图形模型的生物医药试验优化系统包括数据收集模块、图形权重调整模块、路径探索模块和优化调整模块。本发明中，通过实时数据同步整合药物浓度和生物标志物的反应数据，不仅能够覆盖试验全程，还能确保数据的实时更新和精确映射，极大增强试验的可靠性和有效性，动态数据通过实时更新图形模型中的节点和边的权重，使得模型能够准确反映药物间的实际交互效应，利用更新后的数据进行路径分析和药理作用关系标记，进一步加强试验的针对性和科学性，能够快速识别关键变量和作用路径，优化药物组合方案，显著提升了研发效率和成本控制，使得药物研发周期大幅缩短。