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本发明涉及农业技术领域，尤其涉及一种种子包衣及利用种子包衣包被种子的方法与应用。本发明的种子包衣，包括如下质量份数的组分：EM菌菌液1～3份、壳聚糖水溶液10～18份、营养液16～24份、聚乙烯吡咯烷酮水溶液1～3份、聚马来酸酐1～3份、羟甲基纤维素钠水溶液0.5～2份；所述EM菌菌液的初始活菌浓度为1.0×106～1.0×108cfu/mL；所述壳聚糖水溶液的初始浓度为5～8wt％；所述聚乙烯吡咯烷酮水溶液的初始浓度为20～30wt％；所述羟甲基纤维素钠水溶液的初始浓度为6～8wt％。按照本发明的方法包被种子并种植后，不仅可以提高种子发芽率，还具有改善土壤环境，提高作物产量的功效。