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本发明涉及一种短链醇分子在提高出芽短梗霉聚苹果酸产量中的应用，具体涉及利用短链醇分子在提高出芽短梗霉聚苹果酸产量的方法，包括如下步骤：(1)将出芽短梗霉接种于种子培养基，温度为23‑30℃震荡培养，得活化种子液；(2)将步骤(1)中所得活化种子液接种于发酵培养基，温度为23‑30℃发酵培养。该方法根据出芽短梗霉细胞生长及聚苹果酸生物合成途径，采用短链醇分子添加物，建立操作简单的定向调控策略，实现细胞生长及聚苹果酸合成的碳代谢流流向调节，能够大幅度提高聚苹果酸发酵产量和细胞产酸得率，且该方法具有发酵成本低、产量高、技术经济性强等优点，可应用于聚苹果酸发酵工业放大生产。