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本发明公开了一种提高萝卜种质创制效率的方法，包括如下步骤：S1、砧木及接穗的准备：选易出胚的杂交品种做砧木材料，选取皮色肉色脆绿的杂交品种做接穗材料，将砧木和接穗种子进行播种并通过春化；S2、定植；S3、嫁接环境管理：控制环境温度使植株生长，用矮壮素稀释液进行灌根；S4、嫁接时间选择：在砧木的第二个及以后的一级分支处作嫁接部位；接穗的选择为长度为6‑10cm的一级分支；S5、嫁接：将接穗芽嫁接在砧木植株上；S6、嫁接后管理：嫁接完成后通过控制生长环境温度对嫁接植株进行管理；本发明可以有效的提升难出胚材料的游离小孢子出胚率，加快萝卜材料的纯化速度，提升种质创制效率。