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本发明公开了联合加权阈值去噪与均衡判决的变换域二次估计方法，按如下步骤进行：1)联合叠加训练序列与调和序列生成发送序列；2)在OFDM基带系统中，通过叠加训练序列的LS信道估计方法，获得信道频率响应的粗估计；3)将信道频率响应粗估计作幅度相位补偿，再经加宽度为M的窗函数、M点DCT变换后，并对所得序列作低通滤波、时域去噪及序列补零扩展处理，对扩展后的N点序列作N点IDCT变换、去窗及二次幅度相位补偿得4)将所得结果均衡判决得重复M点DCT变换、低通滤波、时域去噪、插值补零及N点IDCT变换，得到频域响应的最终估计本发明消除了数据序列和训练序列对信道估计性能影响，改善了现有的LS信道估计的性能，实现复杂度较低。