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本实用新型提供了一种生物医药用离心萃取分离机，涉及萃取分离机技术领域，包括：分离机主体，安装于分离机主体内部的过滤筒，开设于过滤筒外侧的多个滤孔，螺纹连接于过滤筒顶部的筒盖，安装于筒盖顶部的进料斗，设置于过滤筒顶部的清洁组件，清洁组件包括：工作台、支撑架、升降气缸、伸缩杆、安装筒和清理块。该种生物医药用离心萃取分离机通过过滤组件可以对药液进行二次过滤，便于将药液中的细小杂质过滤干净，提升药液萃取后的纯度，避免杂质残留影响制药品质，并通过清洁组件可以对过滤筒内部清洗干净，清洗完成后，清理块和伸缩杆可以移出过滤筒外部，不会影响过滤筒正常离心萃取药液分离工作使用，也能便于对清理块进行更换。