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本发明公开一种复合微生物有机肥及其制备方法，属于复合微生物有机肥技术领域。本发明复合微生物有机肥包括以下重量份的原料制备：微生物菌剂8‑12份、畜禽粪便30‑35份、农作物秸秆20‑25份、腐殖酸10‑15份、甘蔗渣炭10‑12份、过瘤胃脂肪粉3‑5份、糖蜜3‑5份、壳寡糖1‑3份。本发明复合微生物有机肥中选定固氮假单胞菌、长孢链霉菌、多黏类芽孢杆菌三种菌进行复配，三种菌株通过固氮、养分活化、激素分泌和病害抑制的协同作用，全面促进草莓植株的根系发育、养分吸收和抗逆性。本发明复合微生物有机肥能有效促进草莓植株生长，改善草莓品质并提高产量，同时减少化学肥料和农药残留，降低土壤污染风险，满足消费者对安全、有机草莓的需求。