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本发明公开了一种大小鱼苗分隔培养箱，培养箱内中间设有下隔板与上隔板，鱼苗位于隔离部件的右侧且位于驱赶机构的左侧，伸缩杆使驱赶机构向左移动，下、上隔板与驱赶机构之间的小鱼穿过驱赶机构，到达驱赶机构的右侧，然后伸缩杆继续推动驱赶机构触发隔板开合机构，从而使下、上隔板分离，大鱼穿过上、下隔板，当驱赶机构与隔板开合机构分离时，下隔板与上隔板再闭合，完成大小鱼苗分隔，驱赶板向左移动一定距离，与隔板开合机构接触，上、下隔板分离，驱赶板继续移动，且限制长条与隔板开合机构接触时，上、下隔板开合不变，当驱赶板继续移动且隔板开合机构与限制长条分离，此时上、下隔板闭合，完成整体分隔。