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本申请提供一种基于智能手表的健康监测方法及系统，涉及健康监测技术领域，通过将心率信号转换为心率数据，进而得到智能手表用户在静息状态下的心率变异性；获取智能手表用户在静息状态下的脉搏数据，对脉搏数据进行异常剔除，得到异常剔除后的脉搏数据，基于异常剔除后的脉搏数据确定智能手表用户在静息状态下的脉搏变异性；依据心率变异性和脉搏变异性确定智能手表用户在静息状态下的健康监测系数；获取历史常态生理数据，基于历史常态生理数据确定常态健康区间；根据健康监测系数和常态健康区间对智能手表用户的健康状态进行监测警示，本申请可以有效提高监测数据的质量，并基于生理指标量化用户健康状态，以提高智能手表的用户体验性。