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本发明公开了一种生物制药过滤设备，包括过滤箱、通缝、钢丝刷、电机、第一过滤芯、弹簧和物料出口，所述过滤箱的上侧设置有入料口，且过滤箱的内部设置有外壳，所述电机与转轴相连接，且转轴上开设有通孔，所述第一过滤芯的一端设置有把手，且第一过滤芯的内部开设有凹槽，所述弹簧的一端固定在凹槽的内部，且弹簧的另一端与磁铁相连接，所述过滤箱的侧壁上设置有螺纹件，且过滤箱的内部设置有第二过滤芯和第三过滤芯，所述第二过滤芯的下侧设置有第三过滤芯，且第三过滤芯的下侧设置有过滤层。该生物制药过滤设备，三组滤芯在三组电机和转轴的作用下转动，使滤芯表面网孔中堵塞的杂质在钢丝刷的作用下被清除掉，有效的提高了过滤的效率。