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本发明涉及信息融合技术领域，更具体的说，它涉及一种多源异构数据融合方法及系统。一种多源异构数据融合系统，包括：智能合约自动化平台、终极数据融合模块、数据包数据获取模块、数据包数据处理模块和文件格式转换节点扩充模块。本发明通过智能合约自动化平台实时接收上传数据包，并验证数据包的来源，根据数据包的来源得到该数据包满足的智能合约条件，触发该智能合约条件下相应的数据处理逻辑和协议来对该数据包进行预处理，将预处理完毕的数据传输至终极数据融合端，并输出最终数据融合结果，很好地保证了数据的有效性与准确性，缓解了因数据存在的异构性而给数据集成、管理和分析带来的压力，降低信息孤岛和数据孤立现象出现的概率。