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一种多域蛋白质Linker构建方法，首先，根据未封闭的残基之间的Cα原子距离确定需要构建的Linker氨基酸序列长度；然后，通过随机游走的方式确定Linker中所有Cα原子的坐标，并通过原子冲突和封闭性检验判断所生成的Cα原子的有效性；其次，利用Pulchra方法生成其它原子，并利用蒙特卡罗算法对整个结构进行调整，同时根据二面角、原子冲突和键角等能量指导算法进行搜索；最后，根据蛋白质结构精修工具对最终结果进行精修，从而得到Linker的结构。本发明提供一种预测精度和效率均较高的多域蛋白质Linker构建方法。

本发明提供了一种序列比对的状态监控装置及方法，其中，在该序列比对的状态监控装置中包括：序列比对模块，用于逐个将比对序列中的碱基与参考序列比对；与序列比对模块连接的比对结果输出模块，用于根据序列比对模块的比对，针对比对序列中的每个碱基输出一个比对结果；与比对结果输出模块连接的响应模块，用于根据比对结果输出模块输出的比对结果播放预设声音，实现对序列比对状态的监控。其将视觉的比对结果转换为听觉，以此相关人员能够直接利用听觉的功能，根据判断听到的不同预设声音的情况来直接获得序列比对结果的好坏，不仅可以免去解读繁琐的序列结果文件，而且可以随时监测序列比对的比对状态，简单易懂，方便快捷。