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本发明公开了一种基于照明光源和图像分析的微藻密度测量方法及系统，该微藻密度测量方法包括：信息处理终端对采集到的图像进行预处理，包括统一图像大小、RGB通道分离的操作；计算以及优化各清晰度计算相关因子、综合清晰度、RGB通道色差、综合色差的指标在不同密度微藻溶液条件下的非线性变化的散点图及其非线性拟合曲线；优化非线性拟合曲线，提升散点与拟合后曲线的相关性和曲线平滑度，兼顾各个算法最适区间的优势，减少局部异常；对优化后的综合清晰度在不同微藻密度条件下测试所得的散点图进行非线性拟合；本发明通过拟合和建模获取综合色差、综合清晰度的特征，能准确区分不同密度微藻溶液成像图像的不同特征。