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本发明提供了一种双亲性生物基可降解水下粘合剂及其制备方法和应用，属于粘合剂和包装材料领域。本发明双亲性生物基可降解水下粘合剂的制备方法以亲水性与疏水性的生物基多官能度单体作为原料，包括如下步骤：(1)加热条件下将儿茶酚单体与功能单体进行预聚，(2)高温以及真空或通氮气下进一步聚合。本发明方法所得聚合物是一种含有可排水膜的疏水链段与末端带有强粘附性儿茶酚基的可降解支化聚酯，使用温度较低，可在水下对多种基材表面进行粘附，且具有良好的长期稳定性。此外，本发明生物基粘合剂可快速降解，对资源与环境保护具有一定的促进作用，在医学材料、包装材料、船舶材料等领域有重大应用价值。