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本发明公开了一种季铵盐抗菌的拒水有机‑无机杂化涂层及合成方法，本发明通过将甲基化的枝化聚乙烯亚胺、长链卤代烃和在惰性气体保护下的溶剂搅拌回流；待反应结束后除去溶剂，得到长链烷基改性的甲基化枝化聚乙烯亚胺；将硅烷偶联剂3‑(2,3‑环氧丙氧)丙基三甲氧基硅烷、去离子水、溶剂混合并搅拌，待反应结束后去除溶剂，得到一定聚合度的表面带环氧基团的聚硅氧烷；然后将其与长链烷基改性的甲基化枝化聚乙烯亚胺分散在溶剂中，在40‑60KHz下超声10‑20分钟；将制备得到的涂料混合物涂在基材上进行固化，得到高透明度的图层。本发明得到的杂化图层既有无机材料的硬度，又具备有机材料的韧性，且该图层具有较好的抗菌能力与耐溶剂性。