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本发明属于干扰素领域，涉及突变体干扰素的制备，特别是指一种猪干扰素α突变体YNS及其制备方法和应用。利用基因工程方法，将天然猪α干扰素基因进行改造，改造的氨基酸位点为H58→Y、E59→N及L61→S，将改造后的基因克隆到pET‑32a载体上构建重组质粒；然后分析猪α干扰素基因的密码子偏嗜性，将鉴定正确的重组质粒克隆到Rosetta表达菌中诱导表达和鉴定。重组蛋白以包涵体形式表达，经纯化和透析处理后，获得纯度较高的猪α干扰素。检测蛋白对Vero细胞的毒性和抗病毒活性，试验结果表明所得的YNS突变体蛋白的CC50为549.5ug/mL，其抗病毒活性为4.29×106U/mg。