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本发明公开一种新型萘二酐分子化合物及其制备和应用，所述新型萘二酐分子化合物的化学结构式见式(1)。其制备具体是在三溴化磷的催化下以戊胺进行烷基化反应，制备中间产物A；通过1,5‑二氨基萘取代中间产物A一边的溴原子进行环合反应，得到中间产物B；通过2‑氨基硫代苯酚取代中间产物B上剩余一边的溴原子，环合后得到新型萘二酐分子。纳米颗粒的制备过程为取新型萘二酐分子在DMSO溶剂中溶解后滴加DSPE‑PEG2000进行包覆，通过旋蒸除去DMSO后，将纳米颗粒均匀分散在纯水溶液中。本发明能够有效改善现有技术的不足，包括增强第二近红外窗口的紫外吸收，改善萘二酐分子的光热转换率，实现对肿瘤细胞的有效杀伤。