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本发明公开了一种具有高比例超笼Na+交换位的FAU分子筛及对含氟电子气的吸附分离应用，该分子筛具有国际分子筛学会IZA认定的FAU分子筛构型，其化学组成摩尔比为Al2O3：mSiO2：nNa2O，氧化物SiO2/Al2O3的摩尔比值m的数值在5‑20。该种分子筛采用有机模板剂、水、硅源及铝源调配成的初始凝胶，加入FAU晶种，调整有机模板剂的电荷密度，组装FAU分子筛不同笼结构进行合成，并经由与含有Na元素固体盐混合和固相交换，实现超笼中Na+交换位比例的调控。和USY2.6商业分子筛相比，本发明中具有高比例超笼Na+交换位的FAU分子筛可以应用于气相体系中的含氟电子气体的吸附分离，尤其是五氟一氯乙烷C2F5Cl(R115)和六氟乙烷C2F6(R116)的吸附分离，且分离效果较好。