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本发明提供一种碳包覆硼掺杂二氧化硅纳米材料及其制备方法，其中制备方法包括如下步骤：A、向硅酸盐和四硼酸盐混合溶液中滴加无机酸，控制pH值，反应后静置，得到硼酸掺杂硅酸溶胶，干燥等处理得硼硅酸凝胶粉末；B、将A步的凝胶粉末与糖类水溶液混合，搅拌后干燥，得到包覆有糖的硼硅酸凝胶粉末混合物；C、将B步骤的粉末混合物加入到浓硫酸中，反应得混合物；D、将C步的混合物缓慢加入到蒸馏水中，搅拌并过滤，过滤物用蒸馏水洗涤后，干燥，即得。优点为：颗粒粒径均一；颗粒粒径、硼的掺杂量、碳的包覆含量等易于控制；可广泛地应用于催化剂、储能材料、有机合成、精细品化工添加剂等领域；工艺简单、成本低，易于规模化生产。