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本发明公开了一种高分散性和高乳化性蛋白乳化剂的制备方法及其在化妆品中的应用，包括，将南瓜籽分离蛋白分散于水中得到蛋白溶液，调节蛋白溶液pH值至碱性并加热，然后用酸调节预热后的蛋白溶液的pH为6～7，经冷冻干燥得到改进的南瓜籽蛋白粉；将得到的南瓜籽蛋白粉分散于去离子水中，磁力搅拌，得到南瓜籽蛋白溶液；将得到的南瓜籽蛋白溶液中加入油相，均质制备得到高分散性和高乳化性蛋白乳化剂。本发明的南瓜籽蛋白粉乳化性能好，1wt％的蛋白分散液就可以乳化80％的油相；此外制备的普通乳液，在45℃加热下储存30天，60℃加热下储存15天和90℃加热下储存6个小时，均未出现出油以及破乳现象；在10000g下离心30分钟也未出现出油和破乳现象。