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本实用新型公开了一种肝素钠提纯设备，本实用新型涉及肝素钠提纯技术领域，包括设备本体，所述设备本体内部设有过滤排杂机构，所述设备本体顶部一侧设有进料口，所述设备本体一侧底部设有封闭机构，所述过滤排杂机构包括两个倾斜导向架和滤网，所述滤网一端设有转轴，所述滤网另一端设有电动推杆，两个所述倾斜导向架相对的一侧表面均开设有导向槽。该肝素钠提纯设备，通过电动推杆将滤网推至倾斜状态，然后驱动电机带动喷水管和清洁刷移动，同时喷水管向滤网喷出水，同时从动杆沿着导向凸块进行移动，配合复位弹簧带动清洁刷进行来回摆动，从而能够将滤网上的杂质清除，并排出到设备本体外部，无需频繁拆卸滤网，提高清洁的便捷性。