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本发明公开了一种基于高空数据与GM灰色迭代的降水量预测方法，包括：步骤1：将高空数据按照高度进行划分，得到X个高度层次数据；步骤2：针对某一时刻的降水量，建立该时刻的地面降水量与该时刻第i个高度层次数据中的第j个气象要素数据xij之间的合关系模型，进行多项式拟合；步骤3：基于GM灰色模型预测未来时间段内第i个高度层次的第j个气象要素数据；步骤4：采用与步骤3相同的方法预测未来时间段内的地面降水量；步骤5：计算最终预测的未来时间段内的地面降水量。发明结合高空与地面气象观测数据对降水量进行耦合分析，充分利用了高空气象探空仪的观测垂直精度，模型的灵敏度较高，所得预测结果较为客观准确。