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本发明提供了一种基于参照食物组的食物分类方法及系统，其包括：S1、选定参与创建参照食物组的营养参数；S2、设置累积贡献率目标值后建立膳食调查数据库；S3、获取每个被调查个体调查期间所摄入的食物名称、食物编码及其调查摄入量；S4、获得调查摄入总量；S5、建立n个数据组；S6、计算调查摄入量IS‑all‑NP并得到变量IS‑all‑NP‑total，然后计算贡献率NPCR‑NP；S7、完成分类参照食物组的建立；S8、完成跨类参照食物组的建立；S9、选定计量单位、用于食物评价的营养参数NP和参照食物组；S10、得到参照食物序列；S11、选定一种待评价食物并将其插入上述参照食物序列，形成评价食物组以获取该评价结果，并对食物进行分类。本发明构造了合理客观的食物综合评价分类方法。