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多数据融合的高光谱水质监测系统，涉及水质监测技术领域，包括主控中心，所述主控中心通信连接有地图构建模块、水质评级模块、光谱校正模块、水质监测模块；为河流设置不同的水质等级，生成不同水质等级的标准光谱图像，获得不同水质等级的光谱图像集合，结合标准光谱图像获得光谱图像差异，根据光谱图像差异构建河流的光谱校正模型，获得若干个监测区域，对各个监测区域的监测光谱图像以及监测流速、监测光照强度进行采集，利用光谱校正模型获得实际光谱图像，根据实际光谱图像获得各个监测区域的水质等级；通过本发明的技术方案，能够更加准确地反映出河流实际的水质等级，有利于相关人员及时掌握河流污染情况。