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本发明公开了一种基于临床数据的症候群监测方法及系统，该方法包括：采集医护人员在书写病历过程中保存的病历文本，对病历文本进行分析以从病历文本中抽取出症候群信息；获取症候群信息对应的患者以及医院信息，并将症候群、患者以及医院信息进行向量转化以得到单次病例特征向量；将单次病例特征向量存入至预设的向量数据库当中，对预设的向量数据库当中的所有单次病例特征向量进行预设处理以得到病例类群；从病例类群中提取病例类群的向量特征，以生成对应的病例类团指纹；当判断到病例类团指纹满足预设的监控条件时，对病历文本对应的症候群进行监控。本发明解决了现有技术中不能对症候群进行准确监控的问题。