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本发明公开了一种自动聚焦的拉曼光谱物质检测系统及方法，包括激光采集模块、电动可调焦透镜、控制通信模块、上位机和电流预测网络，且电动可调焦透镜位于激光采集模块与样品之间；本自动聚焦的拉曼光谱物质检测系统及方法通过电流预测网络，实现对电动可调焦透镜的驱动电流的高精度预测，从而驱动电动可调焦透镜完成自动对焦调节，替代传统依赖人工或单一图像清晰度指标的方式，实现全自动、实时、稳定的对焦控制；通过峰值感知分支模块对光谱中多个局部波段区域进行分析，并在主峰过曝、饱和、削顶或异常扰动时，自动挖掘并利用次优峰区域以辅助判断聚焦状态，从而显著提升了电流预测网络对复杂光谱变形场景下的鲁棒性与容错能力。