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按指定级配空隙率生成均质土样的离散元土样制备方法，包括步骤1：确定颗粒数目，确定根据级配曲线的控制点分区段确定颗粒数目；步骤2单层制样：首先将试样按高度进行分层，通过步骤1按指定级配和孔隙率确定一层的颗粒数目，然后按两层的尺寸生成六面墙，通过移动上下两面墙来压实颗粒；步骤3替换分层处颗粒：首先将步骤2确定的多层试样进行组装，为了消除组装后层与层之间的分层现象，将上下两层之间的颗粒删除，复制下层中间颗粒来进行替换，之后运行足够的步数使颗粒运动平衡。步骤4施加重力和摩擦力：通过步骤3得到所需尺寸的试样后，最后施加重力和摩擦力，运行足够的步数使土体在重力的作用下沉降固结。本发明可以按指定级配和孔隙率快速制得均质离散元土样，计算效率高，能很好的模拟现实土体情况。