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本发明公开了一种用于卫星遥感应用系统的信号抗干扰方法，包括：使用卫星天线接收来自遥感卫星的电磁信号，进行预处理；对预处理后的信号进行干扰检测，当部分尺度的能量异常高时，则判定数字信号中存在干扰；将干扰检测中提取出的特征组合成特征向量，输入基于卷积神经网络构建的分类模型中进行干扰分类，输出各干扰类型的概率，选择概率最大的类型作为判定结果；根据输出的判定结果，采用对应的自适应滤波算法，对数字信号中存在的干扰信号进行抑制，得到净化后的信号；利用母小波函数，对净化后的信号进行逆变换，重构信号；将重构后的信号以数字文件形式保存，并传输至地面站或数据处理中心，以供后续分析和应用。