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本发明涉及基于CMKMC的人机协同智慧医疗辅助决策系统，包括：疾病初诊模块，将临床数据匹配动态医疗认知属性知识库的疾病节点属性，以确定临床疾病疑似病范围、提供临床检查指导，获取初诊结果；精确诊断模块，将疾病初诊模块无法确诊对应的临床数据通过机器学习诊断网络集群以进行疑似病量化患病风险概率分析，获得精诊结果；综合诊断模块，将针对临床疑难疾病的机器学习网络集群精确诊断结果与医疗认知属性知识库中的初诊节点信息进行校验，综合评估获取诊断结论；自进化模块，对系统误诊病例进行分析和再学习，更新医疗认知属性知识库推理路径及节点属性，并调整机器学习诊断网络集群内部参数。本发明具有诊断准确率高、自进化的特点。