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本发明涉及一种醛胺缩合席夫碱改性蛋白制备复合膜的方法，涉及农产生物质功能化领域，包括以下步骤：（1）合成醛胺缩合席夫碱；（2）将蛋白粉溶液溶解于pH值为8~10的碱溶液中，搅拌均匀，得到蛋白溶液；（3）将醛胺缩合席夫碱加入蛋白溶液中，在40~60℃下搅拌20~60min，得到醛胺缩合席夫碱改性蛋白液；（4）将水溶性高聚物溶液加入醛胺缩合席夫碱改性蛋白液中，搅拌均匀，得到混合液；（5）通过浇铸法制得醛胺缩合席夫碱改性蛋白复合膜。其中，缩醛席夫碱加入量为原料总固体质量的10%~50%。本发明中的醛胺缩合席夫碱一方面起到抗菌改性剂作用，赋予复合膜抗菌性能，另一方面起到增塑剂作用，提高复合膜的机械性能。