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本发明公开了一种基于喷泉码的深空多文件传输方法，充分利用喷泉码的无码率特性，充分利用前向信道，减少反向信道上的数据量，提高链路利用率，降低时延。本发明根据最新的丢包率信息，计算所需的编码冗余，提高一次传输的成功率并有效控制冗余；在接收方采用联合译码算法，充分利用编码信息，降低计算复杂度并提高译码成功率；在重传时，根据不同的丢包情况，采取不同的保护策略，减少重传次数；采用多文件联合传输策略，不等待接收方反馈信息，直接对待传输文件进行处理，充分利用链路资源以及降低时延；在CFDP的基础上，将编码包作为数据域的内容发送，保证了良好的兼容性和实用性。本发明针对性的解决了传输时延巨大、链路时变以及信道非对称的问题，并有效控制冗余，减少传输次数，基本实现了深空文件高效可靠传输的目标。