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本发明提供用于网箱孵化麦穗鱼的消毒剂，属于水产养殖技术领域，其制备方法为：将香樟内生菌接入含有蔗糖八乙酸酯和蔗糖硬脂酸酯的PDA液体培养基中培养，发酵完成后灭菌，获得的发酵液萃取，浓缩得香樟内生菌代谢产物；将次氯酸钠溶液和氰尿酸加入到反应釜中，同时通入氯气，反应后降温、过滤、得到二氯异氰尿酸钠；将香樟内生菌代谢产物和二氯异氰尿酸钠中加入柠檬酸盐缓冲剂、梓醇和酪蛋白，混合均匀，即得消毒剂。本发明消毒剂对病毒、真菌和细菌的杀灭率达99％以上，其稳定性更好、溶解度高、药效持续时间更长，对养殖水体不会造成二度污染，提高鱼卵的孵化率，且对麦穗鱼后期鱼苗的生长发育及肉质几乎没有影响。