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一种处理高盐废水的厌氧氨氧化颗粒污泥启动方法，属于污水生物处理领域。装置以升流式厌氧污泥床/MBR作为主体，按照连续流的方式运行。选择海岛海岸采集的底泥作为耐盐菌源，并接种成熟厌氧氨氧化污泥。在运行过程中，先采用低流速培养颗粒污泥，同时小梯度升盐度模式，培养耐盐的颗粒污泥。之后，不改变基质浓度，不断提升进水流速，强化可处理高盐废水的颗粒污泥，最终实现其对高盐废水的脱氮处理。经过124d，在盐度为2.8～3.5％的情况下，连续10天脱氮效率高于90％且污泥平均粒径达到1.9±0.2mm，即启动成功可处理高盐废水的厌氧氨氧化反应器。本发明所述方法借助MBR的完全截留能力，缩短了耐盐颗粒污泥的培养时间，在约124天培养出可耐受高盐度的厌氧颗粒污泥，污泥来源多样，技术简单，在不进行盐度稀释的情况下进行高盐废水生物脱氮处理，且处理效果好，节约运行能耗和费用。