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本实用新型涉及基因测序技术领域，且公开了一种便于内部清理的基因测序装置，包括底板，所述底板底部的中心处固定设置有电机，所述底板顶部的左右两侧均固定安装有电动伸缩杆，两个所述电动伸缩杆的输出端活动连接有托盘，所述托盘的顶部活动套接有环板，所述环板的内侧壁固定设置有限位条，所述限位条的底部与托盘的顶部活动连接，所述限位条的另一端固定连接有连接杆。该便于内部清理的基因测序装置，通过设置电动伸缩杆、托盘、环板、限位条、环形槽和连接块，环板和限位条可对托盘表面进行限位，防止托盘旋转时样品从托盘边缘掉落，通过控制两个电动伸缩杆向下回缩，使托盘向下移动，从而方便对托盘表面进行清理。