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本发明公开了一种区域生态安全格局分析方法及装置、存储介质，涉及智能生态分析技术。本发明输入初始MSPA景观分类图至景观分析模型中，确定出空中探测装置的第一移动路径，获取空中探测装置基于第一移动路径移动时采集到的第一探测数据，基于第一探测数据和第一移动路径，确定空中探测装置对应的第二移动路径，由于第二移动路径是基于第一探测数据和第一移动路径重新确定出的，因此第二探测数据也包含有比第一探测数据更加准确的探测生态数据。最后，探测生态数据是通过高空探测器获取到的目标区域的一手生态数据，因此使用探测生态数据，可以修正初始MSPA景观分类图，从而可以依赖目标MSPA景观分类图对目标区域的生态安全格局进行更加准确的分析。