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本发明公开了一种观察水稻根尖微管横纹排列方式的方法，包括以下步骤：1）将样品使用4wt%的多聚甲醛固定液固定，放入PBS中浸泡3‑5min；2）将步骤1）浸泡后的样品取出、制成标样；3）将步骤2）所得样品用PBS浸泡；然后使用tubulin一抗避光孵育；4）将步骤3）的样品取出，用PBS浸泡，然后使用标记荧光的二抗避光孵育；5)将步骤4）避光处理的样品用PBS浸泡3‑5min、将样品置于载玻片上，使用荧光抗淬灭封片剂封片，Confocal观察并拍照。本发明所提供的观察方法方便、快捷、省时，简便，可以在6‑7小时内即可利用激光共聚焦显微镜看到根尖微管的排列情况。