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本发明涉及一种基于多级融合的轨道高低不平顺故障报警方法。本发明从安装在轨检车的车轴和车体的加速度计获得振动数据作为初始数据，从中利用傅里叶变换获取振动特征作为样本数据，构建相应的证据表。对于一个在线获得的振动数据样本其激活证据表中对应的证据，计算该振动数据样本对与已知样本的欧氏距离，选出距离值最小的五个对应的已知样本，用该五个样本再次激活证据表中对应的证据，利用证据距离计算临近样本的可靠性指标，最后利用ER融合规则，将证据进行多级融合，利用该融合结果估计出不平顺幅值，根据幅值高低进行报警决策。本发明无需对系统的输入和输出之间的可能的复杂关系作任何假定且具有精度高的特点。