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本发明属生物技术及农业技术领域，针对现有研究不能阐释枣花花蜜对蜜蜂的毒性作用的现状，提供一种基于肠道菌群的枣花花蜜导致蜜蜂毒性效应的研究方法；基于枣花花蜜对蜜蜂微生物肠道菌群的改变及差异菌的功能分析，以挖掘枣花花蜜对蜜蜂枣花病发生的机理，为蜜蜂枣花病的防治提供依据。采集蜜蜂肠道粪便中的微生物DNA，用Hiseq2500 PE250测序平台，基于细菌16s rDNA V3‑V4可变区，探究枣花花蜜对蜜蜂肠道菌群的调节，明确枣花病组中上调或下调的菌属。阐明枣花花蜜通过改变肠道菌群抑制外源物质的生物降解和解毒通路、上调生物碱氨基酸生物合成，对蜜蜂产生毒性作用的机制，应用于通过蜜蜂枣花病防治中靶标的选择。