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本发明公开了一种辨别鲤鱼三种肌肉细胞的组织学方法，具体步骤为：将处理后的样品用异戊和液氮冻结；将样品低温冷冻后切片，室温干燥；将切片放入恒温的前处理液中处理，然后用清洗液清洗；将切片中加入清洗液，至恒温后倒出，加入相同温度的ATPase反应液反应，用蒸馏水清洗、浸渍；将切片依次用CaCl2溶液、CoCl2溶液、硫化铵溶液浸泡，中间浸泡结束后用蒸馏水清洗、浸渍；吸取切片多余水分，盖上盖玻片，封片后用光学显微镜观察，即可辨别鲤鱼三种肌肉细胞。有益效果为：本发明辨别方法得到的显微镜图像中红色肉细胞、粉色肉细胞和白色肉细胞分界线明显，能够清晰地辨别鲤鱼三种肌肉细胞的分布。