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本发明适用于生物学研究技术领域，提供了一种蛋白质组学样品前处理清洗装置，包括：底座，所述底座上固定安装有罐体；放置在罐体内且用于清洗蛋白质组学样品的清洗罐，所述清洗罐外壁与罐体内壁相接触，且所述清洗罐顶部设置有一体成型的外沿部；设置在罐体顶部的顶盖，所述顶盖通过设置的搭扣与罐体固定，用于将清洗罐压紧在罐体内，且所述顶盖上设置有加料斗，用于向清洗罐内加入用于清洗蛋白质学样品的PBS缓冲液；其中，所述清洗罐内设置有用于对清洗后的蛋白质学样品进行沥水的过滤沥水组件。本方案提供的蛋白质组学样品前处理清洗装置通过自动化、均匀冷却、高效搅拌、沥水加风干，显著提高了蛋白质组学样品前处理的效率和质量。

本发明涉及一种基于家蚕组织样品进行大规模蛋白质组学鉴定的方法，包括家蚕蛋白质组学样品前处理、分级肽段质谱上机检测和构建家蚕蛋白质数据库。通过优化蛋白提取方法，并采用高pH分级方法将肽段分8级，能尽可能多的提取到家蚕脂肪体样品，提升蛋白质鉴定数目；通过优化上样量和色谱梯度时间防止上样量过大造成样品喷针堵塞；通过优化色谱梯度时间缩短检测时间；建立了含有21878条蛋白质序列的Streamline数据库，该种数据库不仅能鉴定到更多的蛋白质数目，并且该数据库去除了冗余序列，有利于后期蛋白质组学数据分析。本发明建立了稳定、高效的家蚕蛋白质组学鉴定平台，对家蚕蛋白质组学大规模鉴定具有重要意义。

本发明涉及文物检测领域，公开了一种基于蛋白质组学鉴别古代毛织品残片毛种类的方法，具体为：取等量已经混淆的古代山羊毛、绵羊毛、骆驼毛织品样品，用金属盐法和还原法提取角蛋白，分别进行SDS‑PAGE凝胶电泳分离蛋白，用反相微乳液法制备碳量子点溶液作为染色液。将条带酶解，采用HPLC‑MS/MS质谱分析，根据质谱检测得到的氨基酸序列与氨基酸序列数据库对比，鉴定古代毛织品属于山羊毛、绵羊毛还是骆驼毛。这种古代毛织品的检测方法具有凝胶电泳图像清晰，溶解率和提取效率高等优点，非常适合用于年代早、肉眼难以识别的古代毛织品残片不同目科属种的毛种类的鉴定。

本发明公开的是一种分析柞蚕茧中蛋白质组的方法，属于蛋白质组学领域，取样、分层、溶解、胶内酶解等步骤后，分析不同蚕茧层中的蛋白质分布情况，有助于分析柞蚕茧结构与性能的关系；本发明的有益效果是：本发明从蚕茧出发，蚕茧中保留有最完整的蛋白质成分，可实现对蛋白质组的全面综合分析；对柞蚕茧进行分层研究；本发明采用低钠盐体系溶解茧层，对比传统的高浓度中性盐溶液，可降低化学药品的用量，减少杂质离子的引入，缩短纯化处理时间，降低成本，无毒无害；本发明基于蛋白质组学技术，能够快速、高效、准确的对蛋白质进行检测和定量分析。