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本发明公开了一种筛选响应油菜细胞质雄性不育线粒体不育基因逆行调节受体核基因的方法，该方法包含：克隆油菜细胞质雄性不育花粉败育线粒体基因不育基因；构建线粒体基因不育基因的植物表达载体，遗传转化拟南芥；获得差异表达基因DEGs；计算基因间的共表达关系，得到基因间的表达调控关系及调控方向，从而构建基因的共表达网络图；选择候选核基因构建双突纯合的拟南芥突变体；鉴定出能够恢复突变体花粉育性的核基因。本发明解决了现有方法不能准确鉴定出线粒体不育基因核质互作的核基因的问题。本发明通过构建双突的突变体观察花粉育性，能够高效的找到受线粒体不育基因表达共同调控花粉败育的线粒体基因逆行调节受体核基因。

本发明公开了一种与小麦旗叶长和穗长相关的分子标记及其应用，属于作物选种培育技术领域。其中，分子标记为FLL‑5A‑ID1和FLL‑5A‑ID2，FLL‑5A‑ID1可由SEQ ID NO:5和6所示的引物扩增得到，FLL‑5A‑ID2可由SEQ ID NO:7和8所示的引物扩增得到。本发明基于全基因组关联分析开发了一种与小麦旗叶长和穗长相关的分子标记FLL‑5A‑ID1和FLL‑5A‑ID2，此两个分子标记具有扩增稳定、检测效率高等特点，可用于鉴定或辅助鉴定待测小麦旗叶和穗长性状。

本发明涉及植物遗传领域，具体涉及棉花纤维长度相关QTL及其应用。所述棉花纤维长度相关QTL qUHM‑1‑1位于1号染色体，其侧邻标记为BNL3580‑BNL1667，棉花纤维长度相关QTL qUHM‑22‑1位于22号染色体，侧邻标记为NAU3093‑CICR345。本发明的纤维长度相关QTL，在两个个环境中都被检测到，具有不依赖环境的稳定性。