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本发明属于气象分析技术领域，公开了一种基于超立方格树的气象资料索引及可视化分析方法；通过超立方格树SHG‑Tree以时间、空间、要素构造的可用性指标，对气象资料在不同时空粒度及气象要素下建立多层次的非平衡索引树；进行海量气象资料可用性索引，建立可用性索引与气象资料存储的映射，使气象资料存储入库同时建立可用性索引和存储映射；通过可用性视图实时获取检索的数据及数据存储位置；根据气象数据的特征，进行数据库选择与数据可视化分析、数据可用性条件设置与判定、气象数据发现结果可视化分析及数据可用性判定，实现对气象资料的索引。本发明增加了数据可用性分析环节和数据发现结果分析环节，有效地减少了无效数据的下载。