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本发明提供了一种适用于干旱岩溶缺数据地区的水文频率计算方法，包括：对研究区进行地质、水文进行观测并构建岩溶地下水库概化模型、通过SPI值确定枯季持续时间并建立枯季持续时间与频率关系、建立地下水库退水流量与退水时间的关系确定保证率流量等步骤，基于退水时间即为枯季持续时间这一特点，可得到频率和流量的关系，即得到对应某一保证率的来水量。本发明基于岩溶地质具有地表水与地下水互补这一水文循环特性，对“岩溶地下水库”进行一体化分析。不同于现有的分析方法，本发明不需要利用过往的流量数据进行统计分析与计算，避免了欠发达、缺设备、缺数据资料地区因没有流量数据而不能对保证率来水量进行准确的计算，方便可靠。